Το πανεπιστήμιο Αιγαίου αποτελεί ένα από τα νεότερα πανεπιστήμια στην Ελλάδα (1984 - έτος επανίδρυσης). Σήμερα, αποτελείται από 17 τμήματα, 38 Προγράμματα Μεταπτυχιακών Σπουδών (ΠΜΣ), Θερινά Σχολεία και Μαθήματα Δια βίου Μάθησης. Κατατάσσεται ανάμεσα στα μεγαλύτερα πανεπιστήμια της χώρας. Διοικητική έδρα του πανεπιστημίου Αιγαίου είναι η Μυτιλήνη, ενώ σχολές και τμήματά του λειτουργούν σήμερα στις νησιωτικές πόλεις της Μυτιλήνης, της Χίου, του Καρλοβάσου, της Ρόδου, της Ερμούπολης και της Μύρινας, συγκροτώντας ένα πανεπιστήμιο - δίκτυο που καλύπτει όλους τους νομούς του Αιγαίου.

Πανεπιστημιακές μονάδες

Η πανεπιστημιακή μονάδα Λέσβου αναπτύσσεται στην πόλη της Μυτιλήνης και περιλαμβάνει τη σχολή Κοινωνικών Επιστημών και τη σχολή Περιβάλλοντος.

Η σχολή Κοινωνικών Επιστημών αποτελείται από τα εξής τμήματα:

• Τμήμα Κοινωνικής Ανθρωπολογίας και Ιστορίας,
• Τμήμα Γεωγραφίας,
• Τμήμα Κοινωνιολογίας,
• Τμήμα Πολιτισμικής Τεχνολογίας και Επικοινωνίας.

Η σχολή Περιβάλλοντος αποτελείται από το:

• Τμήμα Περιβάλλοντος,
• Τμήμα Επιστημών της Θάλασσας.

Η πανεπιστημιακή μονάδα Σάμου έχει έδρα την πόλη του Καρλοβασίου. Περιλαμβάνει τη σχολή Θετικών Επιστημών, που αποτελείται από τα τμήματα:

• Μαθηματικών,
• Μηχανικών Πληροφοριακών και Επικοινωνιακών Συστημάτων.

Η πανεπιστημιακή μονάδα της Χίου αναπτύσσεται στην πόλη της Χίου. Περιλαμβάνει τη σχολή Επιστημών της Διοίκησης που αποτελείται από τα τμήματα:

• Διοίκησης Επιχειρήσεων,
• Ναυτιλίας και Επιχειρηματικών Υπηρεσιών,
• Μηχανικών Οικονομίας και Διοίκησης.

Η πανεπιστημιακή μονάδα της Ρόδου φιλοξενεί τη σχολή Ανθρωπιστικών Επιστημών, η οποία περιλαμβάνει:

• το Παιδαγωγικό Τμήμα Δημοτικής Εκπαίδευσης,
• το τμήμα Επιστημών της Προσχολικής Αγωγής και του Εκπαιδευτικού Σχεδιασμού,
• το Τμήμα Μεσογειακών Σπουδών.

Τον Σεπτέμβριο του 2000 ιδρύθηκε στη Σύρο το τμήμα Μηχανικών Σχεδίασης Προϊόντων και Συστημάτων.

Η πανεπιστημιακή μονάδα Λήμνου έχει έδρα την πρωτεύουσα του νησιού, τη Μύρινα. Το ένα από τα τρία τμήματα της Σχολής Περιβάλλοντος, το τμήμα Επιστήμης τροφίμων και Διατροφής λειτουργεί τα τελευταία χρόνια στο νησί.